Журнал СФУ. Химия / Потенциальные противомикробные агенты на основе тимидина с помощью расчетов In Silico DFT

Полный текст (.pdf)
Номер
Журнал СФУ. Химия. 2023 16 (2)
Авторы
Хосен, М. А.; Кавсар, С.М.А.
Контактная информация
М. А. Хосен: Лаборатория химии углеводов и нуклеозидов (LCNC), Университет Читтагонга Народная Республика Бангладеш, Читтагонг; С.М.А. Кавсар: Лаборатория химии углеводов и нуклеозидов (LCNC), Университет Читтагонга Народная Республика Бангладеш, Читтагонг
Ключевые слова
thymidine analogs; quantum mechanical calculation; molecular docking; toxicity and bioactivity prediction; аналоги тимидина; квантово-механический расчет; молекулярная стыковка; прогнозирование токсичности и биологической активности
Аннотация

Модификация гидроксильной (–OH) группы тимидина путем ацилирования может вызвать изменения в антимикробных и противоопухолевых свойствах тимидина, которые исследуются в данной работе. Текущее исследование сосредоточено на вычислительном изучении in silico различных исследований in silico и биоактивности. Мы связываем оптимизацию тимидина и его ацилированных аналогов с применением теории функционала плотности (DFT) с теорией уровней B 3LYP/3–21G, чтобы продемонстрировать их тепловые свойства, пограничную молекулярную орбиталь, плотность состояний (DOS) и молекулярный электростатический потенциал (MESP). Все аналоги были обнаружены с показателем, превышающим их исходный атом, что указывает на теоретическую стабильность этих соединений. Чтобы глубже осознать эти наблюдения, были проведены исследования молекулярного докинга против PARP1 человека (E.coli-BL21, PDB: 4ZZZ) и обнаружены значительные энергии связи и нековалентные взаимодействия. Данные о биологической активности показали, что соединения в прогнозируемых случаях соответствовали стандартным значениям. Более того, данные о токсичности показали более безопасный уровень оценки для всех изученных аналогов тимидина. Эта работа демонстрирует, что потенциальные аналоги тимидина связываются с бактериальными патогенами, чтобы обойти их активность, и открывает возможности для разработки новых лекарственных препаратов-кандидатов, которые могут воздействовать на бактериальные и грибковые патогены

Страницы
168–179
EDN
SIKRGW
Статья в архиве электронных ресурсов СФУ
https://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/150145