Журнал СФУ. Математика и физика / Оптимизация условий автоматического синтеза бензоксазольных фосфорамидных олигонуклеотидов

Полный текст (.pdf)
Номер
Журнал СФУ. Математика и физика. 2024 17 (6)
Авторы
Барановская, Елизавета Е.; Поддубнякова, Софья А.; Ломзов, Александр А.; Васильева, Светлана В.
Контактная информация
Барановская, Елизавета Е.: Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН Новосибирск, Российская Федерация; Поддубнякова, Софья А.: Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН Новосибирск, Российская Федерация; Ломзов, Александр А.: Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН Новосибирск, Российская Федерация; Васильева, Светлана В.: Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН Новосибирск, Российская Федерация
Ключевые слова
phosphoramidate benzoazole oligonucleotide; PABAO; automatic synthesis; Staudinger reaction; фосфорамидные бензоазольные олигонуклеотиды; ФАО; автоматический синтез; реакция Штаудингера
Аннотация

Фосфорамидные бензоазольные олигонуклеотиды (ФАО) — недавно разработанные производные нуклеиновых кислот, несущие межнуклеотидные N-(бензоазол)-фосфорамидные остатки. Их можно получить классическим методом автоматического твердофазного фосфитамидного синтеза, в котором стадия окисления заменена реакцией Штаудингера с азидным модификатором. В данной работе проведена оптимизация протокола синтеза N-бензоксазольных олигонуклеотидов. Она заключалась в снижении концентрации азидо-реагента и сокращении времени синтеза. Оптимизированные условия синтеза позволяют снизить расход бензоксазолазида в 2.5 раза, а также сократить на 20 мин время, необходимое для введения единичной модификации при синтезе олигонуклеотида. Полученные преимущества будут использованы для масштабированного синтеза ФАО с целью изучения их в биомедицинских приложениях

Страницы
776–782
EDN
TECAXP
Статья в архиве электронных ресурсов СФУ
https://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/154106