Журнал СФУ. Математика и физика / Эффективная модель воды для моделирования больших молекулярных систем

Полный текст (.pdf)
Номер
Журнал СФУ. Математика и физика. 2015 8 (4)
Авторы
Зализняк, Виктор Е.
Контактная информация
Зализняк, Виктор Е.:
Ключевые слова
water model; molecular dynamics simulation; модель воды; молекулярная динамика
Аннотация

В статье предлагается простая и эффективная, с вычислительной точки зрения, модель воды. Эта одноточечная модель включает в себя потенциал Леннард-Джонса и усреднённое по углам диполь-дипольное взаимодействие. Для параметризации модели используются эксперименталь- ные данные для воды при различных температурах. Основным целевым параметром была выбрана плотность воды. Параметризация проводилась в области температур от 300 до 350 K и давле- ний до 10.1 МПа. Свойства воды, вычисленные с помощью предлагаемой модели, сравниваются с экспериментальными данными и данными, полученными с помощью модели воды TIP4P/2005. Сравнение показывает, что предлагаемая модель достаточно хорошо воспроизводит выбранные свойства. В статье также приводится вычислительная схема метода молекулярной динамики для NPT ансамбля. Предлагаемая модель не только воспроизводит основные свойства воды, но и требует значительно меньше вычислений по сравнению со стандартными многоточечными мо- делями воды. Данная модель предназначена для моделирования больших молекулярных систем, возникающих в различных задачах наногидродинамики

Страницы
487–496
Статья в архиве электронных ресурсов СФУ
https://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/19863