Журнал СФУ. Биология / Функциональное исследование организации генного окружения транспозонов хелитронов в геномах Bos taurus

Полный текст (.pdf)
Номер
Журнал СФУ. Биология. 2018 11 (1)
Авторы
Бабий, А.В.; Ковальчук, С.Н.; Глазко, Т.Т.; Глазко, В.И.; Косовский, Г.Ю.
Контактная информация
Бабий, А.В.: Центр экспериментальной эмбриологии и репродуктивных биотехнологий Россия, 127422, Москва, ул. Костякова, 12, стр. 4; Ковальчук, С.Н.: Центр экспериментальной эмбриологии и репродуктивных биотехнологий Россия, 127422, Москва, ул. Костякова, 12, стр. 4; Глазко, Т.Т.: Центр экспериментальной эмбриологии и репродуктивных биотехнологий Россия, 127422, Москва, ул. Костякова, 12, стр. 4; Российский государственный аграрный университет – МСХА им. К.А. Тимирязева Россия, 127550, Москва, ул. Тимирязевская, 49; Глазко, В.И.: Центр экспериментальной эмбриологии и репродуктивных биотехнологий Россия, 127422, Москва, ул. Костякова, 12, стр. 4; Российский государственный аграрный университет – МСХА им. К.А. Тимирязева Россия, 127550, Москва, ул. Тимирязевская, 49; Косовский, Г.Ю.: Центр экспериментальной эмбриологии и репродуктивных биотехнологий Россия, 127422, Москва, ул. Костякова, 12, стр. 4
Ключевые слова
Bos taurus; helitrons; genes; genome; functions; breeds; Bos taurus; хелитроны; гены; геном; функции; породы
Аннотация

Мобильные элементы (МЭ) являются хорошо известными факторами геномной изменчивости и эволюции. Будучи важными источниками регуляторных элементов, МЭ способны оказывать существенное влияние на архитектуру и экспрессию генома хозяина. В настоящее время особый интерес вызывает исследование ДНК транспозонов хелитронов. Предполагается, что хелитроны вовлечены в горизонтальный перенос генетического материала между удаленными таксонами и способны значительно повлиять на геном хозяина за счет механизмов перетасовки экзонов (exon-shuffling) и «захвата» генов (gene capture). Благодаря этому и в связи с высоким уровнем полиморфизма и относительно высокой плотностью в геномах эукариот, хелитроны могут быть использованы в качестве «якорей» для геномного сканирования различных пород сельскохозяйственных животных с целью выявления их генофондного стандарта. В настоящее время не существует комплексных исследований, посвященных хелитронам и их взаимодействию и влиянию на геномный ландшафт крупного рогатого скота (Bos taurus). Ранее нами была показана возможность использования консенсусной последовательности 3'-конца хелитронов семейства Heligloria для полилокусного генотипирования (геномного сканирования) с целью оценки консолидированности разных пород крупного рогатого скота. В настоящем исследовании для изучения контекстных особенностей участков ДНК, фланкированных инвертированными повторами фрагментов хелитронов Heligloria, были секвенированы подобные геномные участки (около 550 п.н.), принадлежащие трем породам крупного рогатого скота, и проанализированы функциональные особенности выявленных генов. Таким образом, в данной работе представлена функциональная организация генного окружения транспозонов хелитронов в геномах разных пород Bos taurus и обсуждается возможное влияние подобного распределения хелитронов на геномы исследованных групп животных

Страницы
60-74
Статья в архиве электронных ресурсов СФУ
https://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/30751

Лицензия Creative Commons Эта работа лицензируется по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License (CC BY-NC 4.0).