Журнал СФУ. Биология / Роль электростатических взаимодействий в формировании комплекса между бактериальной люциферазой и NADPH:FMN-оксидоредуктазой

Полный текст (.pdf)
Номер
Журнал СФУ. Биология. 2018 11 (1)
Авторы
Деева, А.А.; Немцева, Е.В.; Кратасюк, В.А.
Контактная информация
Деева, А.А.: Сибирский федеральный университет Россия, 660041, Красноярск, пр. Свободный, 79; Немцева, Е.В.: Сибирский федеральный университет Россия, 660041, Красноярск, пр. Свободный, 79; Институт биофизики СО РАН Федеральный исследовательский центр «Красноярский научный центр СО РАН»; Кратасюк, В.А.: Сибирский федеральный университет Россия, 660041, Красноярск, пр. Свободный, 79; Институт биофизики СО РАН Федеральный исследовательский центр «Красноярский научный центр СО РАН» Россия, 660036, Красноярск, Академгородок, 50/50
Ключевые слова
бактериальная биолюминесценция; люцифераза; NADPH:FMN- оксидоредуктаза; молекулярный докинг; белок-белковые взаимодействия; туннелирование субстрата; bacterial bioluminescence; luciferase; NADPH:FMN-oxidoreductase; molecular docking; protein-protein interactions; substrate transfer
Аннотация

Методом молекулярного докинга исследован возможный механизм формирования белкового комплекса между бактериальной люциферазой и NADPH:FMN-оксидоредуктазой из Vibrio harveyi за счет электростатических взаимодействий. Комплекс между исследуемыми ферментами необходим для передачи люциферазе субстрата – молекулы FMNH2, которая подвержена быстрому автоокислению с образованием активных форм кислорода при контакте с внутриклеточным растворителем. В настоящей работе с помощью метода Монте- Карло было получено многообразие возможных положений NADPH:FMN-оксидоредуктазы относительно люциферазы с учетом потенциала электростатического поля, создаваемого люциферазой. Показано, что среди структур с наименьшей энергией взаимодействия имеется комплекс, в котором ориентация активных центров обоих ферментов способствует прямой передаче флавина. Высказано предположение о роли водородной связи между Arg291 и Gln197 люциферазы и оксидоредуктазы соответственно в стабилизации комплекса между белками

Страницы
16-29
Статья в архиве электронных ресурсов СФУ
https://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/67842

Лицензия Creative Commons Эта работа лицензируется по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License (CC BY-NC 4.0).